从三之岛返回其他区域需要明确触发剧情条件并合理利用交通工具。首先需确保已完成三之岛的当前主线任务，例如化解树果森林的素利拍事件或交付陨石任务，这些剧情进展会直接影响返程路线的放开。若任务未完成，需先和决定因素NPC对话推进剧情，例如在三岛港口和船长或宝可梦网络中心的阿锦交互。

完成剧情后，返回一之岛或红莲岛需乘坐希加罗普号渡轮。前往三岛港口寻找停靠的渡轮，和其对话后选择目的地，若选项未放开则需检查任务进度。部分玩家也许因遗漏任务道具（如三岛通行证）而无法返程，需回溯任务链，例如在一之岛灯火温泉获取岩石粉碎技能或和二之岛游戏厅老板对话获取后续线索。

若需快速返回关都地区，可通过飞行技能直接抵达已解开的城市。前提是已获取秘传技能机HM02（飞翔）并装备给宝可梦，且目标城市道馆已击败。在三岛港口运用飞行技能可跳过部分航线流程，但需注意飞行点仅限已访问过的城镇，未解开区域仍需依赖渡轮。

寻觅三岛期间提议提前规划路线，避免因道具或技能缺失导致卡关。例如火山洞穴需碎岩术，而树果森林需清除障碍物。返程后若需再次前往三岛，可重复运用渡轮体系，但需确认航线是否因剧情重置需从头解开。部分隐藏道具（如顶级球或技能机器）也许分布在返程途径上，提议在离开前完成全岛搜刮。若遇到渡轮无法交互等异常情况，可尝试重启游戏或检查背包任务物品栏是否已满。